Cell2SentenceAvointa rakennetta, joka muuntaa yksittäisisessä solussa ilmentyvän geeni-ekspressiotiedon "solulauseisiin", joten LLM-laskimelle voidaan analyysin ja biologisten aavistusten luomista tehdä.

Cell2Sentence on avoimesti saatavilla oleva kehyksetyökalu, joka muuntaa yksittäiskeliripotukseen liittyvät geeniatokset "kellussanoiksi" analyyseihin ja tuntemukseen suuret kieliopilliset mallit (LLM). Se ehdottaa geenien ilmentymien vektorien järjestelyn muuttamista sellaisten laskentamallien mukaan, joissa geneet tilat ovat ylöspäin. Samaan aikaan ne muodostavat luennan geenien nimistä järjesteltyinä eri geneille yleisempien ilmentymistasojen mukaan. Sen avulla LLM-mallit pystyvät mallinnusta suorasukaisesti käsittelemään yksittäiskeliripotukseen perustuvaa RNA-sekvenssiohjelmaa. Ohjelmisto sisältää C2S-Scale-malleja, jotka yhdistävät transkriptomiksi ja tekstuaalisiin tietoihin ja sallivat etenkin yksittäiskelitason tehtäviä kuten muuttujan vaikutusennusteen, tietokannan yhteenveto ja yksittäiskeliripotukseen liittyvän kuvailu ja biologinen kysymysjärjestelmä. C2S-Scale mallit ovat saatavilla Hugging Face -palvelussa ja niiden perustana on Pythia- ja Gemma-2 -mallien mallit. Cell2Sentence on suunniteltu tutkijoille ja tiedemiehille, jotka työskentelevät yksittäiskeliripotukseen perustuvaisten tietojen kanssa. Ohjelmistoa on päivitetty uusilla mallilla ja ominaisuuksilla, jotka sisältävät yksityiskohtainen toimitusmallien täydentämisen sekä useamman solun käyttämisen malleihin. Se sisältää myös Pythian mallien sovellus, jota käytetään solutyyppien ennustamiseen, tyypin ehdoilliseen syöttöön sekä monimutkaisiin useamman solun kaksiulotteisiin taitekoja, joita on koulittu yhteensä 57 miljoonan humanistilla ja hiiriellä solulla. Cell2Sentence-kirjanpaino on dokumentoitu ja tarjoaa opiskeluoikeuksia sen käytölle, myös esimerkein siitä, miten kehittää ja muokata monikelloista esitystapaa. Cell2Sentence:n kehityksen on vallinnut van Dijk -laboratorio, ja sen on julkaistu preprint -versio bioRxiv:ssä. Cell2Sentence tarjoaa yhteiskelitason löydön seuraavan sukupolven tekniikkaa LLM:ien avulla.