How do I use BioMCP with Claude Desktop?

Configure an MCP server entry using biomcp serve. See Claude Desktop setup.

How do I request full article text now?

Use positional sections: biomcp get article 22663011 fulltext The same model applies to other entities: biomcp get trial NCT02576665 eligibility biomcp get gene BRAF pathways biomcp get variant "BRAF V600E" predict

Why do invalid dates fail immediately?

Date validation is performed before network calls. Examples of invalid inputs: 2024-13-01 (invalid month) 2024-02-30 (invalid day) 2023-02-29 (non-leap-year day) This behavior provides immediate feedback and avoids unnecessary API requests.

Where are cached files stored?

Run biomcp cache path to print the managed HTTP cache directory on your machine. BioMCP uses platform cache directories underneath that resolved root. Typical locations: Linux: ~/.cache/biomcp/ macOS: ~/Library/Caches/biomcp/ The cache generally contains: http/ for HTTP responses, downloads/ for retrieved text artifacts.

Does BioMCP require API keys?

No for most workflows. Optional keys improve access for specific enrichments and source variants. See API keys.

biomcpBioMCP: Πρωτόκολλο Κειμένου Μοντέλου Βιοϊατρικού Πεδίου (Biomedical Model Context Protocol)

— (0)

Αξιολογήθηκε από Daniel Nikulshyn·Ενημερώθηκε Ιούλιος 2026

Επισκόπηση

Η BioMCP (Διατροφή Μοντέλων Συγκέφτα Ισχυρισμών) είναι ένα εργαλείο που παρέχει ενιαία διεπαφή για την αναζήτηση και ανάλυση ιατρικών δεδομένων. Εφαρμόζει ερευνητές, ιατρόδες, και εντολές χρήστη να χρησιμοποιούν μια ενιαία γλωσσολογία εντολών για την αναζήτηση, το επικέντρωση και την μετάθεση σε διαφορετικές πηγές χωρίς την reconstruction των ροτών. Η BioMCP υποστηρίζει την αναζήτηση δημοσιεύσεων, την μετάθεση μεταξύ οντοτήτων, την ανάλυση μελετώνπρωτότυποιπρωτότυποιπρωτότυποι, και πίσω σε_paper_paper_trails_paper. Επίσης, προσφέρει χαρακτηριστικά όπως η ενίσχυση και η μερική διαδικασία.

Βασικές λειτουργίες

Αναζητήστε δημοσιεύσεις σε PubTator3 και Europe PMC
Διαγραμμίσετε PMID/PMCID/DOI συνδιαλέκτους
Επιχειρηματολογήστε Semantic Scholar με φίλτρα
Φλερτιάζετε με gene, variant, φάρμακο, Krankheit, pathway, protein ή άρθρο
Αναλύστε οι μελέτες locall με native terminal, SVG και PNG charts
Ινίστε και batch processing με biomcp enrich και biomcp batch

Τιμές

Μοντέλο: Free
Κατηγορία: Διευθυντές MCP
Βαθμολογία: Καμία κριτική ακόμα

Περιπτώσεις χρήσης

Αναζήτηση Βιβλιογραφίας

Χρησιμοποιήστε το BioMCP για την αναζήτηση άρθρων σε PubTator3 και Europe PMC, αφαιρώντας τα PMID/PMCID/DOI αναγνωριστικά.

Ανάλυση Μελετών

Χρησιμοποιήστε το BioMCP για την ανάλυση μελετών τοπικά με ατομικό σήμα, SVG και PNG χάρτες για κατεβασμένα datasets-style cBioPortal.

Υπέρ και κατά

Υπέρ

Ενιαία γραμμή interface για αναζήτηση και ανάλυση βιοιατρικών δεδομένων
Υποστηρίζει αναζήτηση μελετών σε πολλαπλά πηγές
Απαιτούμενο μετατοποποίηση μεταξύ πραγματών χωρίς να χρειάζεται να ανακατασκευάσετε ρυθμίσεις
Ενεργοποιεί τοπική έρευνα μελετών με ατομικό σήμα, SVG και PNG χάρτες

Κατά

Πολύς εγκλώβιος πυρήνας διδασκαλία λόγω μοναδικής γραμματικής εντολών
Εκτείνεται μόνο σε πηγές βιοιατρικής

Κριτικές

Σύνδεση για κριτική.

Καμία κριτική. Γίνε ο πρώτος!

Ερωτήσεις

How do I report reproducible issues?

Include: exact command, expected vs actual behavior, biomcp --version, relevant environment details, whether the issue reproduces with --json.

Asked by Anya Sokolova · May 29, 2026

Is BioMCP suitable for final clinical decisions?

BioMCP is a retrieval and workflow tool. Clinical decisions require domain-expert review and institutional validation processes.

Asked by Fiorella Bianchi · May 25, 2026

How do I inspect available commands quickly?

biomcp list biomcp list trial biomcp list variant

Asked by Ekaterina Orlova · May 5, 2026

Why are some fields missing?

BioMCP returns concise defaults and depends on upstream source completeness. When you need more detail: request a section, switch to JSON, verify source availability with biomcp health --apis-only.

Asked by Thandiwe Dlamini · Mar 25, 2026

How do I deploy BioMCP as an MCP server, and how is authentication handled?

Use biomcp serve for local stdio clients. Use biomcp serve-http --host <host> --port <port> for remote Streamable HTTP deployments; the MCP endpoint is /mcp, with /health, /readyz, and / available for probes. The HTTP transport is unauthenticated by design. BioMCP does not implement user login, bearer tokens, OAuth, or per-user authorization. Put remote deployments behind your own gateway, reverse proxy, SSO/mTLS layer, VPN, or private network policy. Provider keys for built-in sources are environment variables on the BioMCP process. See the MCP server reference and API keys.

Asked by Amina Diallo · Mar 14, 2026

Κάνε μια ερώτηση

Εναλλακτικές για Διευθυντές MCP

Playwright MCPΔιευθυντές MCP

Διακομιστής MCP ανοιχτού κώδικα που επιτρέπει στα LLM να ελέγχουν πραγματικούς προγράμματα περιήγησης μέσω Playwright και στιγμιότυπων προσβασιμότητας.

4.8 (6)

Free