
概要
主な機能
- 文献検索をPubTator3とEurope PMCで実行
- Duplicated PMID/PMCID/DOIの排除
- セマンティックシューラーを追加(フィルタリングを含む)
- エンティティ間のピボット検索(遺伝子、変異、薬剤、疾患、経路、タンパク質、または論文)
- ローカル解析(ネイティブのターミナル、SVG、PNGのチャートを含む)
- 特性の強化とバッチ処理(biomcpエンリッシュとbiomcpバッチを使用)
料金
- モデル
- Free
- カテゴリー
- マルチクラウンドプロトコルサーバー
- 評価
- まだレビューはありません
ユースケース
文献の検索
BioMCP を使用して、PubTator3 と Europe PMC などのソースを対象に、PMID/PMCID/DOI の重複を排除して、エンティティ間のピボット検索が可能になります。
研究データの分析
BioMCP を使用して、ダウンロードした cBioPortal のデータセットを対象に、ネイティブのターミナル、SVG、PNG チャートを使用したローカル解析が可能になります。
メリット & デメリット
メリット
- 生物医療データの統合されたインターフェイスを提供
- 複数のソースをサポートする文書検索
- エンティティの間でピボット検索を可能にする
- ローカルでデータを解析でき、ネイティブのターミナル、SVG、PNGのチャートを使用できる
デメリット
- 学習曲線が急上昇するため、コマンド言語が独特
- 生物医療データのみをサポート
レビュー
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Q&A
再現される問題を報告するにはどうしますか?
以下を含む:正確なコマンド、期待される動作と実際の動作、biomcp --version、環境の詳細、--json で問題が再現されるかどうか。
Asked by Anya Sokolova · May 29, 2026
BioMCP は最終的な医療上の決定に適していますか?
BioMCP は取得およびワークフローツールです。医療上の決定には、ドメインエキスパートレビューおよび機関の検証プロセスが必要です。
Asked by Fiorella Bianchi · May 25, 2026
利用可能なコマンドを迅速に確認するにはどうしますか?
biomcp list biomcp list trial biomcp list variant
Asked by Ekaterina Orlova · May 5, 2026
なぜ一部のフィールドが欠けていますか?
BioMCP は簡潔なデフォルト値を返し、上流ソースの完全性に依存しています。詳細が必要な場合は:セクションを要求し、JSON に切り替え、biomcp health --apis-only でソースの उपलब性を確認してください。
Asked by Thandiwe Dlamini · Mar 25, 2026
BioMCPをMCPサーバーとしてデプロイし、認証はどのように処理されるのか
ローカルのstdioクライアントの場合、biomcp serveを使用します。リモートでStreamable HTTPデプロイの場合、biomcp serve-http --host <ホスト> --port <ポート>を使用します。MCPエンドポイントは/mcpであり、/health、/readyz、/はプローブに使用できます。HTTPトランスポートは設計上の制限により認証されません。BioMCPは、ユーザーログイン、ベアラー トークン、OAuth、またはユーザーごとの認可を実装しません。リモートデプロイは、独自のゲートウェイ、リバース プロキシ、SSO/mTLSレイヤー、VPN、またはプライベート ネットワーク ポリシー_behindに配置します。組み込みソースのプロバイダー キーは、BioMCPプロセス上の環境変数です。MCPサーバーリファレンスとAPIキーを参照してください。
Asked by Amina Diallo · Mar 14, 2026
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